Program Studi Bioteknologi FMIPA UHO diselenggarakan berdasar pada SK pendirian Program Studi No. 331/KPT/2016dengan tanggal SK izin operasional 13 sepetember 2016. Saat ini PS Bioteknologi FMIPA UHO merupakan satu-satunya PS Bioteknologi jenjang Strata 1 (S-1) dikawasan timur Indonesia dan sudah menjadi anggota dari Ikatan Program Studi Bioteknologi Indinesi (IPSBI) sejak tahun 2019 Program Studi Bioteknologi FMIPA UHO hadir untuk menjawab tantangan pendidikan bidang Bioteknologi dan diharapkan dapat menjadi ‘problem sover’ seiring dengan pengembangan penelitian-penelitian bidang biologi terapan dan bioteknologi yang sangat dibutuhkan untuk kemajuan dan kemandirian suatu bangsa.

Program Studi Bioteknologi FMIPA UHO didukung dengan sumberdaya yang kompenten didukung dengan bioteknologihijau (tanaman dan industri pangan) dan bioteknologi biru (kemaritiman dan industri akuakultur)dengan sarana dan prasarana yang memadai untuk menghasilkan lulusan yang dapat bersaing didunia kerja. hal ini sesuai dengan tujuan didirikanya Program Studi Bioteknologi FMIPA UHO yaitu untuk: Menghasilakan sarjana bioteknologi yang adaptif, inovativ, dan kreativ yang memiliki keunggulan terhadap pengembangan IPTEKS dalam pemanfaatan biodiversitas Kawasan Wallaceadan coral triangle dengan integritas tinggi; Menghasilkan penelitian bidang bioteknologi yang aplikatif di bidang sains dan industri serta menunjang koservasi genetik dan lingkungan hidup sehingga meningkatkan kesejahteraan manusia dan konservasi sumber daya hayati; Menghasilkan karya ilmiah yang dapat dipublikasikan pada jurnal nasional terakreditasi dan/atau jurnal internasional bereputasi; Menghasilkan karya pengabdian dalam bidang bioteknologi yang dapat dimanfaatkan oleh masyarakat luas, instansi pemerintah, swasta dan dunia industri maupun stakeholder tertentu; Meningkatkan kualitas dan kuantitas sumber daya manusia, peralatan, sarana prasarana guna mendukung pelaksanaan Tridarma perguruan Tinggi yang berdayaguna dan kompetitif secara nasional dan/atau internasional; Memperbanyak kerjasama dan memperbaiki mutu link dengan institusi domestik nasional maupun internasional untuk menopang peningkatan kualitas SDM di Program Studi S-1 Bioteknologi; Memiliki sistem manajemen program studi S-1 yang terpadu, transparan dan akuntabel.